《方案》指出，濕地保護是生態(tài)文明建設的重要內容，事關國家生態(tài)安全，事關經濟社會可持續(xù)發(fā)展，事關中華民族子孫后代的生存福祉。要實行濕地面積總量管控，到2020年，全國濕地面積不低于8億畝，其中，自然濕地面積不低于7億畝，新增濕地面積300萬畝，濕地保護率提高到50%以上。嚴格濕地用途監(jiān)管，確保濕地面積不減少，增強濕地生態(tài)功能，維護濕地生物多樣性，全面提升濕地保護與修復水平?！斗桨浮访鞔_了擬建立完善的一系列濕地保護修復制度。
在完善濕地分級管理體系方面，根據生態(tài)區(qū)位、生態(tài)系統(tǒng)功能和生物多樣性，將全國濕地劃分為國家重要濕地（含國際重要濕地）、地方重要濕地和一般濕地進行管理，并探索開展?jié)竦毓芾硎聶鄤澐?。在實行濕地保護目標責任制方面，確定全國和各省（區(qū)、市）的濕地面積管控目標，逐級分解落實。合理劃定納入生態(tài)保護紅線的濕地范圍，實施濕地“占補平衡”制度，將濕地面積、濕地保護率、濕地生態(tài)狀況等保護成效指標納入地方各級人民政府生態(tài)文明建設目標評價考核等制度體系。在健全濕地用途監(jiān)管機制方面，按照主體功能定位確定各類濕地功能，實施負面清單管理。完善涉及濕地相關資源的用途管理制度，依法對濕地利用進行監(jiān)督，嚴厲查處違法利用濕地的行為。在建立退化濕地修復制度方面，明確濕地修復責任主體，多措并舉恢復原有濕地，增加濕地面積。編制濕地保護修復工程規(guī)劃，實施濕地保護修復工程，對集中連片、破碎化嚴重、功能退化的自然濕地進行修復和綜合整治。在健全濕地監(jiān)測評價制度方面，明確監(jiān)測評價主體，完善濕地監(jiān)測評價規(guī)程和標準體系。建立濕地監(jiān)測數據共享機制和統(tǒng)一的濕地監(jiān)測評價信息發(fā)布制度，加強監(jiān)測評價信息應用，建立監(jiān)測評價與監(jiān)管執(zhí)法聯動機制。
《方案》還提出了濕地保護修復保障機制，明確要求加強組織領導，進一步完善綜合協調、分部門實施的濕地保護管理體制，形成濕地保護合力。抓緊研究制定系統(tǒng)的濕地保護管理法律法規(guī)。加大資金投入力度，形成多渠道投入機制，探索建立濕地生態(tài)效益補償制度。加強濕地基礎和應用科學研究，開展?jié)竦乇Ｗo與修復技術示范。進一步開展?jié)竦乇Ｗo公眾宣傳教育，形成全社會保護濕地的良好氛圍。